鉴别诊断脑肿瘤对肿瘤的治疗有重大意义。不少颅内非肿瘤疾病也可出出颅内压增加及局部的定位症状，常与脑肿瘤混淆，应根据病史、体征，结合CT、MRI、脑血管造影、脊髓液检查，作出鉴别诊断。
1.脑脓肿 病程多为急性及亚急性，继发于脑邻近组织（耳源性，外伤性）或躯体其他部位有感染灶，常有胃冷发热、呕吐、脑膜刺激症状、血及脑脊液白细胞增多，容易鉴别。对慢性脑脓肿鉴别较难，CT、MRI检查可作鉴别。
2.假性脑瘤 又称局限性浆液性脑膜炎，可产生颅内压增高的症状及体征，但未能发现脑占位性病变，可能与蛛网膜炎后粘连、硬脑膜窦血栓形成，耳源性脑积水有关。
3.脑结核病 常有身体其他部位结核史和低热、血沉快、淋巴细胞增多、脑脊液中持续性淋巴细胞增多，据此并进行CT、MRI扫描可作鉴别。
4.癫痫 特发性癫痫没有颅内高压及局灶性脑症状，发作过后无明显症状，病情较稳定，有反复发作历史。
5.其他 此外，还要与颅内动脉瘤，蛛网膜下隙出血，慢性硬膜下血肿、脑积水、颅肉寄生虫性囊肿、偏头痛等鉴别，根据病史、体征，结合X线颅骨片或CT、MRI检查，必要时脑血管造影可作鉴别。
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